近日,上海交通大學(xué)分子醫(yī)學(xué)研究院楊朝勇團(tuán)隊(duì)和胃腸外科趙剛團(tuán)隊(duì)合作,在液體活檢新方法及臨床應(yīng)用研究方面取得重要進(jìn)展,相關(guān)研究以《DNA納米光刻構(gòu)建高度有序的微流控納米界面,并用于高效捕獲和釋放循環(huán)腫瘤細(xì)胞》(DNA Nanolithography Enables Highly Ordered Recognition Interface in Microfluidic Chip for Efficient Capture and Release of Circulating Tumor Cells)為題發(fā)表在《德國(guó)應(yīng)用化學(xué)》(Angewandte Chemie International Edition),影響因子為12.257。
目前臨床上腫瘤診斷主要依賴組織活檢,但存在侵入性強(qiáng)、易產(chǎn)生并發(fā)癥、采樣偏差性大等局限。基于血液中循環(huán)靶標(biāo)的體外檢測(cè)(“液體活檢”)只需抽取外周血檢測(cè),是近年來(lái)新興的腫瘤診斷技術(shù)。
與傳統(tǒng)組織活檢相比,檢測(cè)原發(fā)或轉(zhuǎn)移灶中脫離進(jìn)入外周血循環(huán)的腫瘤細(xì)胞(CTC)具有腫瘤分子信息全、侵入性小、取樣方便等優(yōu)勢(shì)。CTC分析技術(shù)的挑戰(zhàn)在于如何從數(shù)億個(gè)血細(xì)胞中識(shí)別捕獲數(shù)個(gè)到數(shù)十個(gè)痕量的CTC,其難度堪比大海撈針。
針對(duì)這一挑戰(zhàn),分子醫(yī)學(xué)研究院楊朝勇團(tuán)隊(duì)和胃腸外科趙剛團(tuán)隊(duì)聯(lián)合攻關(guān),提出了微流控芯片DNA納米光刻新策略(ApTDN-Chip),突破了微流控界面上無(wú)法有序、精準(zhǔn)排布識(shí)別分子的瓶頸,實(shí)現(xiàn)了CTC的高效捕獲及下游分析。
ApTDN-Chip通過(guò)DNA框架實(shí)現(xiàn)了識(shí)別分子(核酸適體)在微流控界面上可控排列成高度有序、且直立的納米形貌,突破了傳統(tǒng)微流控界面由于修飾不均一導(dǎo)致的捕獲效率低的問(wèn)題。
通過(guò)多例臨床樣本測(cè)試,團(tuán)隊(duì)驗(yàn)證了所發(fā)展的芯片僅需0.5mL外周血就可有效區(qū)分胃腸癌患者。
此外,DNA框架結(jié)構(gòu)在界面上合理的空間間距降低了核酸適體的局部擁擠,使核酸酶更易于水解核酸適體,從而保證了CTC高效無(wú)損釋放,實(shí)現(xiàn)下游的細(xì)胞培養(yǎng)及基因突變檢測(cè)。
該團(tuán)隊(duì)還將此技術(shù)應(yīng)用于臨床上疑難患者的精準(zhǔn)診療中。某晚期胃癌患者由于存在凝血功能障礙無(wú)法進(jìn)行穿刺活檢,且臨床一線、二線抗癌藥物均無(wú)法良好緩解病情。因此,楊朝勇團(tuán)隊(duì)和趙剛團(tuán)隊(duì)利用發(fā)展的液體活檢新技術(shù),對(duì)該名患者外周血中捕獲的CTC進(jìn)行測(cè)序,得到患者基因突變圖譜,從而精準(zhǔn)選擇靶向藥物,用藥后患者病情部分緩解。
該研究由分子醫(yī)學(xué)研究院和胃腸外科聯(lián)合攻關(guān)完成,聯(lián)合團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人楊朝勇和趙剛為共同通訊作者。該研究工作得到國(guó)家自然科學(xué)基金和上海高水平地方高校創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)等項(xiàng)目支持。
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原文標(biāo)題:DNA納米光刻技術(shù)有望助力腫瘤精準(zhǔn)診斷?
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