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人類基因組計劃的成果推動生物信息學研究的發展．基于疾病表型相似性策略尋找功能上存在聯系的致病基因，稱作“表型相似基因”，具有重要的研究價值和廣闊的應用前景，成為一個新興的研究熱點，然而，生物醫學領域尚沒有利用計算機方法開展基于“基因一疾病一表型”關系網絡的表型相似基因搜索研究．對此。利用疾病公開數據庫構建了包含基因、疾病、表型這三類異構類型節點的疾病信息網絡。并設計了基于疾病信息網絡的相似基因搜索算法gSim-Miner.針對疾病表型數據的特點，設計了剪枝策略提高算法效率．通過在真實數據上的實驗，驗證了疾病信息網絡對搜索表型相似基因的適用性，以及gSim-Miner算法的有效性，執行效率和可擴展性．
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