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基于深度學習的放療靶區自動勾畫

5RJg_mcuworld ? 來源:未知 ? 作者:李倩 ? 2018-11-19 18:40 ? 次閱讀

騰訊醫療AI實驗室又有新研究。

這次跟美國加州大學合作,在國際權威期刊《Medical Physics》發表最新研究成果:

《器官神經網絡深度學習用于快速和全自動整體頭頸危及器官靶區勾畫》

AnatomyNet: Deep Learning for Fast and Fully Automated Whole-volume Segmentation of Head and Neck Anatomy

該研究成果能讓AI在頭頸等重要器官的放射治療規劃中,發揮精準規劃作用,最大限度將放射劑量集中在靶區內,而周圍正常組織或器官少受或免受不必要的傷害。

比起單純依靠人類醫生,可以提升診療規劃效率,降低勾勒時長,還能提升勾畫準確率。

可以說是患者福音,醫生益友。

基于深度學習的放療靶區自動勾畫

這個研究是這樣的:

每年有超過六十萬人被診斷患有頭頸部癌癥,其中許多人選擇接受放射治療。

但頭頸部重要器官比較集中,解剖關系復雜,如果在治療前未仔細隔離,放療時周圍組織可能會嚴重受損。

在頭頸癌放療過程中,醫生根據患者CT圖像手動描繪放療靶區和危及器官(Organ at Risk,OaR),目的是最大限度將放射劑量集中在靶區內,而周圍正常組織或器官少受或免受不必要的傷害。

然而勾勒過程非常耗時,降低診療效率的同時,更是耽誤了患者的治療時間。

若能讓AI幫助分割過程,輔助放療規劃,肯定能協助醫生、幫助患者。

于是圍繞該問題,騰訊醫療AI實驗室和加州大學提出一種深度學習模型——器官神經網絡(AnatomyNet)。

該模型可以快速地對整張CT的所有切片進行全自動化器官分割(Segmentation),在小于1秒鐘的時間內完成一整幅頭頸CT的危及器官勾畫,大幅度提升放療靶區勾畫效率。

器官神經網絡的輸入是頭頸CT圖像的所有切片。該神經網絡可以一次性產生所有危及器官的預測結果。

具體構建上,器官神經網絡基于常用的三維U網絡(U-net)架構,但是騰訊AI實驗室在三個重要的方面對其進行了擴展:

1)一種新的在整幅CT圖像上進行自動分割的編碼方式,而不是在局部圖像塊上,或者一部分CT圖像切片上分割;

2)在編碼層中,加入三維Squeeze-and-Excitation殘差結構來進行更好的特征表示學習;

3)一種新的結合Dice損失和Focal損失的損失函數,用來更好地訓練該神經網絡。在深度學習的器官分割中,使用這些技巧解決兩個主要的挑戰:a)小器官的分割(比如,視神經和視交叉)。這些小器官僅僅只有幾個切片。b)對于一些器官結構,數據標注不一致以及標注缺失給訓練造成一些問題。

△器官神經網絡危及器官分割結果

如上圖所示,其中綠色為醫生標注,紅色為器官神經網絡預測結果,黃色表示標注和預測重合,結果顯示高度一致。

從下面的動態圖上,可以更清晰看到器官神經網絡預測和醫生標注的連續過程,其中左邊顯示的是醫生標注,右邊顯示的是器官神經網絡預測結果。

從結果上說:和之前MICCAI競賽中最好的方法相比,器官神經網絡平均提升了3.3%的Dice指標。

器官神經網絡僅僅使用0.12秒就可以完全完成一整幅CT圖像(178×512×512)的分割。

該速度極大地縮短了之前方法所用的時間(20分鐘以上)。

除此之外,該模型可以處理一整幅包含所有切片的CT圖像,以及一次性勾畫所有的危及器官,不需要很復雜的預處理以及后處理。

這證明,深度學習可以提升器官分割準確率,簡化自動分割器官的流程。

國際權威期刊刊發

騰訊醫療AI實驗室和加州大學的聯合研究成果,首刊于《Medical Physics》,這是是美國醫學物理學家學會(The American Association of Physicists in Medicine,AAPM)的官方期刊。

該研究成果在期刊上發表后,目前已經被多個機構引用。

美國德克薩斯大學MD安德森癌癥中心(MD Anderson Cancer Center)對騰訊醫療AI實驗室的“器官神經網絡”表示關注,并把該研究成果作為中心一項大規模研究的重要部分。

該中心在美國乃至全球皆享譽盛名,多次被評為美國最佳癌癥研究機構,也是公認的全球最好的腫瘤醫院。

此外,論文一經發布,很快被加拿大瑞爾森大學、中國中科院等多家機構學者在其研究報告中被提及和引用,作為最新的研究突破獲得國內外認可。

一旦更多研究機構和人力參與其中,規模化落地速度可能也會加快,實乃人類福音。

騰訊醫療AI實驗室

最后,簡單介紹下騰訊醫療AI實驗室。

這是騰訊專為醫療領域打造的AI實驗室,創建于2017年年底,目前在硅谷、北京、深圳設立了三個分支。

其作為騰訊醫療健康領域眾重要技術驅動,騰訊AI實驗室主要以學術研究層面發力,希望在AI醫學前沿領域取得突破。

實驗室的主要研究方向是基于自然語言理解、醫學知識圖譜、深度學習、醫療影像、貝葉斯網絡、多模態分析等基礎技術構建醫學知識引擎、醫療推理引擎、臨床輔助診斷引擎、問診對話引擎等智能平臺。

更早之前,騰訊醫療AI實驗室已推出帕金森病運動功能智能評估系統,其他主要產品還包括臨床輔助決策支持系統,面向腦卒中、急性冠脈綜合癥等高危易誤診疾病提供臨床輔助決策支持,以及心電圖智能分析軟件,利用AI技術實現心電圖監測結果的自動判讀和預警等。

今年7月,騰訊醫療AI實驗室還有3篇論文分別被KDD 2018、SIGIR 2018、COLING 2018三個國際頂尖學術會議收錄,論文的主要研究方向為醫療知識圖譜中實體關系的發現和應用。

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原文標題:騰訊醫療AI新突破:提出器官神經網絡,全自動輔助頭頸放療規劃 | 論文

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