在顯微成像系統(tǒng)中,常常會用分辨率來評價其成像能力的好壞。這里的分辨率通常是指光學(xué)系統(tǒng)的極限分辨率以及成像探測器的圖像分辨率。最終圖像所呈現(xiàn)出的實際分辨率,取決于二者的綜合影響。過高的光學(xué)分辨率如果沒有足夠精細(xì)的圖像分辨率來體現(xiàn),則實際分辨率會降低到圖像分辨率以下;如果相機(jī)解析能力過高但光學(xué)系統(tǒng)的分辨率低,同樣也看不清物體的精細(xì)結(jié)構(gòu)。所以在選擇相機(jī)的時候,我們也不妨根據(jù)自己這套系統(tǒng)需要達(dá)到的分辨率來綜合考慮一下(實操性的結(jié)論部分請直接移動到文章最下方)。
1.光學(xué)系統(tǒng)的分辨率
光學(xué)系統(tǒng)的分辨率,是指"物"在經(jīng)過光學(xué)系統(tǒng)后的"像"在細(xì)節(jié)上能被分辨的最小距離。一般我們會用光學(xué)系統(tǒng)所能分辨的兩個像點的最小距離來表示,大于這個距離的兩個像點就能被識別為兩個點,而小于這個距離的兩個點經(jīng)過光系統(tǒng)后就會被識別為一個點。而對于黑白圖樣(熒光樣品其實也是一種黑白圖樣)來說,這個分辨能力也可以用單位距離里內(nèi)能夠分辨的黑白線對數(shù)來表示,間隔越寬的黑白條紋越容易分別(想象一下細(xì)胞的Lamellipodia和Filopodia的差別)。
圖一 從"物"到"像"的失真
存在這個分辨率的原因是因為光學(xué)系統(tǒng)的衍射和像差導(dǎo)致從"物"到"像"的過程中會發(fā)生"失真"。這種失真是空間上高頻信號丟失所導(dǎo)致的(光學(xué)系統(tǒng)可以看作是一個空間上的低通濾波器,只能允許一定帶寬范圍內(nèi)的空間頻率信號通過),通俗的理解就是削弱了由"黑"到"白"過渡的銳度和對比度,使其變得平滑和模糊。下圖所示,黑白條紋的真實灰度可以用一個方波信號表示。在經(jīng)過光學(xué)系統(tǒng)之后,如圖像 A 和下方波形所示,原始信號被"平滑",方波的每一個峰都展寬成一個貝塞爾峰,黑白相交處的信號變化斜率下降到一個固定水平(這個斜率的下降就是以該系統(tǒng)帶寬所做的濾波效果)。當(dāng)我們將原始條紋變的密集(增加空間頻率),該系統(tǒng)仍以固定帶寬進(jìn)行濾波,這樣這些被展寬的峰就會互相交疊,損失重疊部分的對比度從而產(chǎn)生圖像B的效果。如果我們換一個帶寬更寬的系統(tǒng) 2,其信號的高頻部分會被更好的保留,表現(xiàn)為黑白交界處的信號變化斜率更大,對比度也越接近真實情況,如圖像 B'。
回歸到我們熟悉的生物熒光成像,上述分辨率的概念通過瑞利判據(jù)與樣品的發(fā)射光波長和光學(xué)系統(tǒng)的數(shù)值孔徑相聯(lián)系起來。即在傳統(tǒng)寬場熒光下,光學(xué)系統(tǒng)的極限分辨率 d = 0.6λ/NA,波長越短,NA值越大,分辨率越高(可以理解為對空間高頻信號的保留越充分)。
2. 相機(jī)的圖像分辨率
說完了光學(xué)系統(tǒng)的分辨率之后我們來看看相機(jī)的圖像分辨率。圖像分辨率比較好理解,就是單位距離內(nèi)的像用多少個像素來顯示。以我們的ORCA-Flash4.0為例,芯片的像元大小為 6.5 μm,在 40X物鏡的放大倍率下,1 μm的物經(jīng)光學(xué)系統(tǒng)放大為 40 μm的像,這樣的像會由 40/6.5 = 6.15 個像素來顯示,所以圖像分辨率為 6.15 pixel/μm。反推回實際物體,則圖像中的一個像素點表示的實際距離為 1/6.15 = 162 nm (其實就是像元尺寸/放大倍數(shù))。根據(jù)這個原理,我們可以得出像元尺寸越小,其圖像分辨率越高。
3. 相機(jī)采樣與光學(xué)分辨率的匹配關(guān)系
那么要使整個系統(tǒng)達(dá)到光學(xué)上的極限分辨率,我們要如何選擇成像系統(tǒng)使其圖像分辨率相匹配呢? 這里還需要借助上圖中黑白條紋的例子。圖中不管是圖像 A,B還是 B',其圖像在x方向上的灰度都可以用圖像下方的波形圖來展示。相機(jī)的芯片則會在該方向上以像元尺寸為單位距離均勻?qū)η€作積分,得到每個像素的數(shù)值。這個過程就是對一個連續(xù)信號的離散采樣。因為芯片上的像素以固定的距離排列,所以這個采樣在空間上的采樣周期 l 對應(yīng)的就是像元尺寸(更準(zhǔn)確的說是兩像素中心點的間距,因為需要考慮芯片的填充因子),其頻率就是單位距離內(nèi)像素點的個數(shù)。上述黑白條紋圖樣的空間頻率就是白色/黑色條紋重復(fù)出現(xiàn)的頻率,而其條紋間距就是他們在空間上的周期 d。頻率越高,這個周期 d 就越短。根據(jù)Nyquist采樣定理( 詳情請參考網(wǎng)址 ),我們需要以連續(xù)信號最高頻率的2倍作為離散采樣的頻率,才能剛好還原連續(xù)信號的特征。因此我們所需要的芯片采樣周期 l,就應(yīng)該小于等于條紋間距 d 的一半。同樣類推到相距很近的兩個物點也是如此。如此這樣一來我們就能夠?qū)⒐鈱W(xué)極限分辨率和像元尺寸聯(lián)系在一起了。對于生物成像系統(tǒng),光學(xué)上的極限分辨率就是熒光信號變化的最大頻率所對應(yīng)的空間周期 d = 0.6λ/NA,因此像元尺寸 l = d × 放大倍數(shù)/2 (注意物點在經(jīng)過物鏡放大后的像點的距離是d × 放大倍數(shù))。
圖三 "像"的空間頻率和相機(jī)的采樣頻率
1. 已有顯微鏡和相機(jī),希望知道當(dāng)前成像系統(tǒng)的分辨率究竟是多少
我們可以用木桶理論來考慮這個問題。光學(xué)系統(tǒng)的分辨率(光學(xué)分辨率)和相機(jī)的圖像分辨率是整個成像系統(tǒng)分辨率這個"木桶"上的兩塊"木板";成像系統(tǒng)的分辨率等于這兩塊"木板"上比較差的那個。
對于顯微鏡:
光學(xué)分辨率=0.61*λ/NA。
其中λ為波長(對于熒光顯微鏡,就是熒光探針的發(fā)射波長);NA為物鏡的數(shù)值孔徑(可以在物鏡上找到)。
舉一個具體的例子:一臺熒光顯微鏡,采用NA1.4的63倍油鏡,光路中沒有其他放大;觀察509nm的綠色熒光樣品。
(1) 采用濱松Flash 4.0相機(jī),像元大小為6.5 um。其光學(xué)分辨率為:
光學(xué)分辨率 = 0.61*509 nm/1.4 = 222 nm
其相機(jī)的圖像分辨率為:
相機(jī)的圖像分辨率 = 2*6.5 um/63 = 206 nm
比較二者,光學(xué)分辨率較差(即數(shù)值較大),所以整個系統(tǒng)的分辨率是受限于光學(xué)分辨率的,為222 nm。
(2) 如果采用的是一款11 um的相機(jī)。其光學(xué)分辨率不變,仍為:
光學(xué)分辨率 = 0.61*509 nm/1.4 = 222 nm
但其相機(jī)的圖像分辨率為:
相機(jī)的圖像分辨率 = 2*6.5 um/63 = 349 nm
比較二者,相機(jī)的圖像分辨率較差(即數(shù)值較大),所以整個系統(tǒng)的分辨率是受限于相機(jī)像素大小的,為349 nm。
2. 已有顯微鏡,希望知道從成像分辨率的角度如何選擇相機(jī)
首先強(qiáng)調(diào),以下建議僅僅是從成像分辨率的角度。在選擇相機(jī)時,信噪比常常是更加關(guān)鍵的考量。 像 B'。
我們以GFP的發(fā)射波長 λ = 509 nm為例,在使用不同放大倍率的常用顯微鏡物鏡時,其光學(xué)極限分辨率和對應(yīng)的相機(jī)芯片像元尺寸匹配如下表:
原則上來說,實際選用的像元大小應(yīng)小于理想像元大小,像元越小對細(xì)節(jié)的解析越好(但是小于理想值的1/2以后就無顯著性改善了)。
但是從圖像信噪比的角度來說,像元越大能夠得到更高的信噪比。不同相機(jī)除了在像元大小上有所差別,在靈敏度、噪音等方面也是不盡相同。所以在選擇成像系統(tǒng)時要充分考慮實際情況來進(jìn)行多種條件的平衡與取舍。
審核編輯:湯梓紅
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