工作時我們經常會遇到需要臨時保存結果變量的場景,尤其是一些數據處理、模型開發的場景,加載處理速度是個很漫長的過程,于是經常會把這些變量儲存起來。
而儲存變量最常見、最普遍的方法是用pickle,保存為pkl文件。但是如果從寫入和讀取的性能角度考慮,pkl可能真的不是最優選。
Pickle有其獨特的好處,大部分變量不需要進行處理,都能直接存到pkl文件里,但這樣的方便其實是犧牲了部分性能取得的。與之相比,numpy的.npy格式就比pickle性能上快不少。
當然,我們需要有證據支撐這個觀點。所以今天我們就來做個實驗,分別在Python2和Python3中對比 numpy 和 pickle 兩種存儲格式(.npy, .pkl) 對數據的存儲和讀取的性能對比。
1. Python2中, npy與pkl的性能對比
首先初始化數據:
import numpy as np
import time
import cPickle as pkl
import os
all_batches = []
for i in range(20):
a1 = np.random.normal(size=[25600, 40])
label = np.random.normal(size=[25600, 1])
all_batch = np.concatenate([a1, label], 1)
all_batches.append(all_batch)
all_batches = np.array(all_batches)
print(all_batches.shape)
# (20, 25600, 41)
然后測試使用pickle保存和讀取時間的耗時,以及整個文件的大小:
s_t1 = time.time()
pkl_name = "a.pkl"
with open(pkl_name, "wb") as f:
pkl.dump(all_batches, f)
pkl_in_time = time.time() - s_t1
print("pkl dump costs {} sec".format(pkl_in_time))
s_t2 = time.time()
with open(pkl_name, "rb") as f:
new_a = pkl.load(f)
pkl_out_time = time.time() - s_t2
print("pkl load costs {} sec".format(pkl_out_time))
pkl_size = os.path.getsize(pkl_name)
print("pkl file size: {} byte, {} mb".format(pkl_size, float(pkl_size)/(1024*1024)))
結果如下:
即:
pkl dump costs 67.7483091354 sec
pkl load costs 52.1168899536 sec
pkl file size: 497437110 byte, 474.392995834 mb
然后再試一下npy的寫入和讀?。?/p>
s_t3 = time.time()
npy_name = "a.npy"
with open(npy_name, "wb") as f:
np.save(f, arr=all_batches)
npy_in_time = time.time() - s_t3
print("npy save costs {} sec".format(npy_in_time))
s_t4 = time.time()
with open(npy_name, "rb") as f:
new_a = np.load(f)
npy_out_time = time.time() - s_t4
print("npy load costs {} sec".format(npy_out_time))
npy_size = os.path.getsize(npy_name)
print("npy file size: {} byte, {} mb".format(npy_size, float(npy_size) / (1024 * 1024)))
結果如下:
即:
npy save costs 20.718367815 sec
npy load costs 0.62314915657 sec
npy file size: 167936128 byte, 160.15637207 mb
結果發現,npy性能明顯優于pkl格式。
通過多次測試發現,在Python2中,npy格式的性能優勢全面碾壓pkl,工程允許的情況下,在Python2中,我們應該在這二者中毫不猶豫地選擇npy.
2.Python3中, npy與pkl的性能對比
Python2已經是過去式,重點還要看Python3.
在Python3中,與Python2的代碼唯一一句不一樣的是pickle的引入:
# Python2:
import cPickle as pkl
# Python3:
import pickle as pkl
其他代碼基本一樣,替換代碼后,重新運行程序,讓我們看看在Python3上,npy格式和pkl格式性能上的區別,首先是pkl格式的表現:
ckenddeMacBook-Pro:Documents ckend$ python 1.py
(20, 25600, 41)
pkl dump costs 24.32167887687683 sec
pkl load costs 4.480823040008545 sec
pkl file size: 167936163 byte, 160.15640544891357 mb
然后是npy格式的表現:
npy save costs 22.471696853637695 sec
npy load costs 0.3791017532348633 sec
npy file size: 167936080 byte, 160.1563262939453 mb
可以看到在Python3中pkl格式和npy格式的存儲大小是基本相同的,在存儲耗時上也相差無幾。但是在讀取數據的時候,npy相對于pkl還是有一定的優勢的。
因此,如果你的程序非常注重讀取效率,那么我覺得npy格式會比pkl格式更適合你。
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