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基于NVIDIA DGX A100 80GB的生物計算引擎

NVIDIA英偉達(dá)企業(yè)解決方案 ? 來源:NVIDIA英偉達(dá)企業(yè)解決方案 ? 作者:NVIDIA英偉達(dá)企業(yè)解 ? 2022-05-13 11:17 ? 次閱讀

百圖生科(BioMap)是一家生物計算驅(qū)動的生命科學(xué)平臺公司,致力于將先進(jìn) AI 技術(shù)與前沿生物技術(shù)相結(jié)合,構(gòu)建獨特的靶點挖掘及藥物設(shè)計能力,開發(fā)創(chuàng)新的藥物和診斷產(chǎn)品

利用生物計算引擎,加速對復(fù)雜疾病機理的發(fā)現(xiàn)進(jìn)程,從而提升生命科學(xué)研發(fā)的效率。

百圖生科基于 NVIDIA DGX A100 80GB 和自身龐大的計算能力,構(gòu)建獨特的生物計算引擎,提高了計算密度、性能和靈活性。

亟需優(yōu)化網(wǎng)絡(luò)環(huán)境,解決數(shù)據(jù)科學(xué)問題

為了開發(fā)和整合多種先進(jìn)的 AI 算法芯片傳感器,多組學(xué)分析,類器官模擬等技術(shù),構(gòu)建獨特的生物計算引擎,建立高質(zhì)量、高效率的靶點篩查和藥物設(shè)計能力,構(gòu)建基于高維度多組學(xué)、高通量干濕試驗閉環(huán)、高精準(zhǔn)抗體設(shè)計、高性能生物計算平臺能力,百圖生科希望利用生物計算引擎,構(gòu)建強大的 AI 技術(shù)及計算平臺和前沿生物技術(shù)平臺,希望開發(fā)針對生物計算需求的超級計算集群、高性能蛋白質(zhì)計算芯片、高性能圖數(shù)據(jù)庫、高等級的數(shù)據(jù)安全與隱私計算引擎,支撐 EB 級別的海量數(shù)據(jù)存儲計算需求,比如超大規(guī)模的蛋白質(zhì)預(yù)訓(xùn)練模型、圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)靶點分析、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測和模擬。通過強大的算力服務(wù)器支持,可以幫助實現(xiàn)快速解決更龐大、更復(fù)雜的數(shù)據(jù)科學(xué)問題,更好地建立生物計算引擎和強大的 AI 技術(shù)及計算平臺。

網(wǎng)絡(luò)改造,提高跨節(jié)點使用效率

基于以上挑戰(zhàn),百圖生科采用了 NVIDIA DGX A100 80GB,將深度學(xué)習(xí)訓(xùn)練、推理和分析整合至一個易于部署的統(tǒng)一 AI 基礎(chǔ)架構(gòu)中,擁有一個更簡單快捷的解決人工智能的方法。

百圖生科參考了 DGX A100 的標(biāo)準(zhǔn)架構(gòu)和網(wǎng)絡(luò)互聯(lián)建議,決定按標(biāo)準(zhǔn)建議進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)改造,采用了 NVIDIA 網(wǎng)絡(luò)交換機,其中將 NVIDIA InfiniBand QM 8700 做計算互聯(lián),NVIDIA Ethernet MSN3700 做存儲和管理網(wǎng)絡(luò),可以讓整個集群全線速計算,提高跨節(jié)點使用效率。

更高效利用前沿生物技術(shù)與 AI

當(dāng)前生物醫(yī)藥行業(yè)普遍面臨一個非常嚴(yán)峻的問題,即“雙十定律”,具體來說就是一款新藥從研發(fā)到上市,平均需要 10 年時間和 10 億美元的投入,且成功率不足 10%。越來越多的醫(yī)藥企業(yè)在尋求如何利用人工智能技術(shù)提高行業(yè)的運行效率。

當(dāng)前基因技術(shù)的發(fā)展已經(jīng)進(jìn)入到數(shù)據(jù)爆發(fā)式增長的階段,隨著更多組學(xué)數(shù)據(jù)的不斷積累,包括血液、組織、器官等宏觀系統(tǒng)的連續(xù)觀測數(shù)據(jù)的結(jié)構(gòu)化都在逐漸成熟之中;人工智能新的算法應(yīng)用也涉及到了很多領(lǐng)域,如無人駕駛、人臉識別、復(fù)雜的知識圖譜構(gòu)建等;成熟的云計算服務(wù)也在為各行各業(yè)的轉(zhuǎn)型發(fā)展提供強大的算力支持,AI 技術(shù)賦能生物制藥行業(yè)加快發(fā)展的基本條件都已具備。

“作為生物計算引擎驅(qū)動的創(chuàng)新藥物研發(fā)平臺,借助 NVIDIA AI 計算平臺,在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測、親和力預(yù)測等場景,NVIDIA DGX A100 相比其他硬件解決方案計算性能提升了 10-20 倍。百圖生科將更高效地利用前沿生物技術(shù) + AI,解決生命科學(xué)行業(yè)的高價值問題,攜手行業(yè)伙伴打造創(chuàng)新藥物管線,助力人類健康事業(yè)發(fā)展。”百圖生科副總裁周達(dá)表示。

本案例中,NVIDIA 精英級合作伙伴信弘智能助力百圖生科部署了高效的 AI 計算平臺。點擊“閱讀原文”詳細(xì)了解 AI 基礎(chǔ)架構(gòu)的通用系統(tǒng) NVIDIA DGX A100。

原文標(biāo)題:NVIDIA DGX A100 助力百圖生科構(gòu)建獨特的生物計算引擎

文章出處:【微信公眾號:NVIDIA英偉達(dá)企業(yè)解決方案】歡迎添加關(guān)注!文章轉(zhuǎn)載請注明出處。

審核編輯:湯梓紅

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