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在醫(yī)療AI領(lǐng)域砥礪前行的中科大學(xué)子

醫(yī)健AI掘金志 ? 來源:雷鋒網(wǎng) ? 作者:醫(yī)健AI掘金志 ? 2021-05-10 09:36 ? 次閱讀

作為國(guó)字號(hào)的科研基石,中科大依靠學(xué)術(shù)層面的踏實(shí)耕耘,很大程度上影響了中國(guó)的醫(yī)療科技風(fēng)向。

談?wù)撘凰髮W(xué)撐起一個(gè)城市的代表,中科大和合肥的CP組合,一定榜上有名。

在合肥的“大湖名城 創(chuàng)新高地”立城口號(hào)中,創(chuàng)新二字便由中科大所撐起。

事實(shí)上,在醫(yī)療科技的學(xué)術(shù)和產(chǎn)業(yè)發(fā)展中,中科大也占有同樣舉足輕重的位置。

中科大在這方面的積淀,最早可以追溯至創(chuàng)校之初13個(gè)系之一的生物物理系。中科大也是我國(guó)最早實(shí)行學(xué)科交叉的開拓者之一。

此后,中科大陸續(xù)孵化了生命科學(xué)學(xué)院、生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院、放射醫(yī)學(xué)物理中心等多個(gè)教學(xué)機(jī)構(gòu)和研究中心。

如果以AlphaFold2在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)領(lǐng)域的成功為參考,早在第六屆的CASP(蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)關(guān)鍵技術(shù)分析大賽)上,中科大的兩位畢業(yè)生,周耀旗和許錦波就包攬了獨(dú)立服務(wù)器組冠軍和季軍的成績(jī),而另一位中科大的余立渤,又獲得了群體服務(wù)器比賽的第二名。

再比如,2020年,來自中科大放射醫(yī)學(xué)物理中心的科研團(tuán)隊(duì),又在人工智能放射治療領(lǐng)域取得了重要突破。他們提出了一種利用深度卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)放射治療中患者劑量分布全新方法,為未來的自動(dòng)放療計(jì)劃奠定了又一個(gè)根基。

以上的例子不一而足。

人工智能時(shí)代,大學(xué)的科研和力量,一直被譽(yù)為領(lǐng)航產(chǎn)業(yè)發(fā)展的旗幟和AI軍備賽的人才儲(chǔ)備庫(kù)。

如果說,前幾天雷鋒網(wǎng)《醫(yī)健AI掘金志》盤點(diǎn)的《清華系醫(yī)療AI大佬》,是以產(chǎn)業(yè)變革和業(yè)務(wù)派為見長(zhǎng)的創(chuàng)業(yè)先鋒。

而中科大作為國(guó)字號(hào)的科研基石,則依靠在理工學(xué)科的踏實(shí)耕耘,帶領(lǐng)著中國(guó)涌向頂尖技術(shù)的潮水方向。

為此,雷鋒網(wǎng)《醫(yī)健AI掘金志》為大家復(fù)盤了那些在醫(yī)療AI領(lǐng)域砥礪前行的中科大學(xué)子。(以下排名不分先后)

醫(yī)學(xué)影像AI

邁瑞醫(yī)療董事長(zhǎng) 李西廷

1976年,李西廷畢業(yè)于中科大物理系低溫物理專業(yè),是深圳邁瑞生物醫(yī)療電子股份有限公司的創(chuàng)業(yè)元老,現(xiàn)為公司董事長(zhǎng)。

1982年至1984年,在法國(guó)巴黎第11大學(xué)作訪問學(xué)者。李西廷是中國(guó)第一家在美國(guó)紐交所上市的醫(yī)療設(shè)備公司邁瑞生物的創(chuàng)業(yè)元老,現(xiàn)為公司總裁,并與徐航共同擔(dān)任首席行政官。徐航、成明和和李西廷被稱為邁瑞的“三劍客”。

2016年4月,李西廷向母校中科大捐贈(zèng)市場(chǎng)價(jià)值數(shù)百萬元的120臺(tái)自動(dòng)體外除顫器(AED),使得中科大成為安徽配備急救裝置AED的第一所高校。

2021年4月,李西廷以215億美元財(cái)富位列《2021福布斯全球富豪榜》第82名。

羅徹斯特大學(xué)教授羅杰波

羅杰波教授是1984年進(jìn)入中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)無線電系學(xué)習(xí)。1995年于美國(guó)羅切斯特大學(xué)獲得博士學(xué)位。曾任柯達(dá)公司研究院首席科學(xué)家。

羅杰波教授是ACM、AAAI、IEEE、SPIE和IAPR等國(guó)際著名學(xué)會(huì)的Fellow,圖像處理、計(jì)算機(jī)視覺機(jī)器學(xué)習(xí),數(shù)據(jù)挖掘等領(lǐng)域著名國(guó)際學(xué)者。

羅杰波教授曾于“柯達(dá)實(shí)驗(yàn)室”從事研究長(zhǎng)達(dá)十五年,并擔(dān)任該實(shí)驗(yàn)室首席科學(xué)家。

2011年秋,羅教授正式加入美國(guó)羅徹斯特大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)系。他的研究涉及圖像處理、計(jì)算機(jī)視覺、機(jī)器學(xué)習(xí)、數(shù)據(jù)挖掘、醫(yī)學(xué)影像分析、普適性計(jì)算等多個(gè)前沿領(lǐng)域。

中科院計(jì)算所周少華

周少華博士現(xiàn)任中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)講座教授、中科院計(jì)算所客座研究員、香港中文大學(xué)(深圳)客座教授,曾在西門子醫(yī)療研究院任職Principal Expert和高級(jí)研發(fā)總監(jiān),致力于研發(fā)與圖像相關(guān)的創(chuàng)新及產(chǎn)品

他已經(jīng)編撰了五本學(xué)術(shù)專著,發(fā)表了200+篇學(xué)術(shù)期刊及會(huì)議論文,并擁有140+項(xiàng)授權(quán)專利。

他多次因其學(xué)術(shù)成就和創(chuàng)新貢獻(xiàn)而獲獎(jiǎng),包括發(fā)明奧斯卡獎(jiǎng)、西門子年度發(fā)明家、馬里蘭大學(xué)ECE杰出校友等。他熱心奉獻(xiàn)于專業(yè)社區(qū),是行業(yè)頂級(jí)協(xié)會(huì)MICCAI財(cái)長(zhǎng)兼理事、開源項(xiàng)目MONAI(Medical Open Network for AI)咨詢顧問、頂級(jí)期刊Medical Image Analysis 和IEEE Trans. Medical Imaging等編委、頂級(jí)會(huì)議AAAI、CVPR、ICCV、MICCAI和NeurIPS等領(lǐng)域主席、《視覺求索》公眾號(hào)聯(lián)席主編、Fellow of IEEE、AIMBE (美國(guó)醫(yī)學(xué)與生物工程院)、NAI(國(guó)家發(fā)明家學(xué)院)。

平安集團(tuán)首席科學(xué)家 肖京

肖京博士本科畢業(yè)于中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué),碩士則被保送至中科院自動(dòng)化研究所。隨后,他前往卡耐基梅隆大學(xué)計(jì)算機(jī)系讀博,拜美國(guó)工程院院士金出武雄(Takeo Kanade)教授門下,主攻計(jì)算機(jī)視覺領(lǐng)域。

畢業(yè)后,肖京博士先后進(jìn)入愛普生、微軟就職,帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)進(jìn)行多領(lǐng)域的算法研發(fā)工作,直至2015年3月加入平安,并且相繼推出胃癌檢測(cè)、肝癌識(shí)別、骨齡預(yù)測(cè)、糖網(wǎng)篩查等多項(xiàng)醫(yī)療AI能力。

2019年10月21日,第九屆“吳文俊人工智能科學(xué)技術(shù)獎(jiǎng)”獲獎(jiǎng)名單正式公示,肖京博士榮獲吳文俊人工智能杰出貢獻(xiàn)獎(jiǎng),這一獎(jiǎng)項(xiàng)也被譽(yù)為「中國(guó)智能科學(xué)技術(shù)最高獎(jiǎng)」,代表人工智能領(lǐng)域的榮譽(yù)象征。

科大訊飛智慧醫(yī)療事業(yè)部總經(jīng)理 陶曉東

陶曉東,現(xiàn)任科大訊飛智慧醫(yī)療事業(yè)部總經(jīng)理,畢業(yè)于中科大,是美國(guó)約翰霍普金斯大學(xué)博士,IEEE高級(jí)會(huì)員。

陶曉東的研究方向?yàn)獒t(yī)學(xué)影像。曾服務(wù)于GE,從事醫(yī)學(xué)影像研究,曾在飛利浦醫(yī)療放射解決方案擔(dān)任首席架構(gòu)師。

2017年,陶曉東正式加入科大訊飛,致力于科大訊飛在智慧醫(yī)療領(lǐng)域的技術(shù)研發(fā)、產(chǎn)品落地及市場(chǎng)推廣等工作。

柏視醫(yī)療(陸遙、沈爍、徐晨陽)

徐晨陽博士現(xiàn)任柏視醫(yī)療科技董事合伙人,IEEE Fellow。

中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)畢業(yè)后,徐晨陽在1999年約翰霍普金斯大學(xué)獲得博士學(xué)位,后在約翰霍普金斯大學(xué)進(jìn)行博士后研究,并擔(dān)任影像科學(xué)中心和計(jì)算機(jī)集成外科手術(shù)系統(tǒng)及技術(shù)中心擔(dān)任副研究員。

徐晨陽博士曾任西門子硅谷創(chuàng)新中心首席技術(shù)官和總經(jīng)理、西門子中國(guó)研究院醫(yī)療影像應(yīng)用研發(fā)中心聯(lián)合創(chuàng)始主任、西門子美國(guó)研究院醫(yī)療介入影像研究室主任經(jīng)理。

徐晨陽博士也是世界第一個(gè)商業(yè)三維心臟影像制導(dǎo)標(biāo)測(cè)系統(tǒng)CartoMerge的共同發(fā)明人、技術(shù)帶頭人、產(chǎn)品研發(fā)經(jīng)理。該系統(tǒng)用于治療世界性難題心臟房顫,自2005年問世以來,已治療世界各地上百萬的病人。在以數(shù)十億美元快速增長(zhǎng)的心臟房顫市場(chǎng),該系統(tǒng)已成為介入醫(yī)療市場(chǎng)上劃時(shí)代的產(chǎn)品。

另外,在十多個(gè)關(guān)于腫瘤、心血管、腦疾病等全新的醫(yī)療影像商業(yè)產(chǎn)品的研發(fā)中,徐博士帶領(lǐng)的團(tuán)隊(duì)做出了主要貢獻(xiàn),這些產(chǎn)品給西門子及其商業(yè)合作伙伴產(chǎn)生了數(shù)十億美元的銷售額。

陸遙畢業(yè)于中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)數(shù)學(xué)系,是中國(guó)科學(xué)院數(shù)學(xué)與系統(tǒng)科學(xué)研究院與美國(guó)雪城大學(xué)雙博士。

在博士期間,他又被自己的導(dǎo)師送到了美國(guó)紐約州立大學(xué)上州醫(yī)學(xué)院學(xué)習(xí)醫(yī)學(xué)影像。

博士畢業(yè)后,陸遙跟隨計(jì)算機(jī)輔助診斷領(lǐng)域國(guó)際權(quán)威Heang-ping Chan教授在美國(guó)密西根大學(xué)醫(yī)學(xué)院從事乳腺癌醫(yī)學(xué)影像的研究。

回國(guó)后,陸遙在中山大學(xué)工作,任中山大學(xué)數(shù)據(jù)科學(xué)與計(jì)算機(jī)學(xué)院教授兼計(jì)算醫(yī)學(xué)成像實(shí)驗(yàn)室主任,同時(shí)也是國(guó)家腫瘤醫(yī)學(xué)協(xié)同創(chuàng)新中心科研骨干。

2017年,陸遙和沈爍等幾位在工業(yè)界有著十幾年經(jīng)驗(yàn)的合伙人,一同創(chuàng)立了柏視醫(yī)療。

沈爍現(xiàn)任柏視醫(yī)療CEO,1995年考入中國(guó)科大數(shù)學(xué)系,后獲得普渡大學(xué)博士學(xué)位。

他曾任國(guó)家物聯(lián)網(wǎng)標(biāo)識(shí)管理公共服務(wù)平臺(tái)總工、中科院網(wǎng)絡(luò)中心物聯(lián)網(wǎng)實(shí)驗(yàn)室主任、中國(guó)互聯(lián)網(wǎng)絡(luò)信息中心實(shí)驗(yàn)室主任,創(chuàng)立過醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)服務(wù)公司 (BIMT.com)。

倫斯勒理工學(xué)院(RPI)教授閆平昆

閆平昆畢業(yè)于中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué),現(xiàn)任倫斯勒理工學(xué)院(RPI)生物醫(yī)學(xué)工程系的教授。在加入RPI之前,他是美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院(NIH)的高級(jí)臨床科學(xué)家。

他的研究重點(diǎn)主要是,利用機(jī)器學(xué)習(xí)和計(jì)算機(jī)視覺技術(shù)的醫(yī)學(xué)影像信息學(xué)和介入腫瘤學(xué)指導(dǎo)。

閆平昆在知名期刊上發(fā)表了百余篇同行評(píng)審文章,他還獲得MICCAI 2005最佳論文獎(jiǎng)和IJCARS-MICCAI 2016最佳論文獎(jiǎng)。

百度智慧醫(yī)療主任研發(fā)架構(gòu)師 許言午

許言午畢業(yè)于中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)計(jì)算機(jī)系,曾于2006年獲得中科大創(chuàng)新基金,2008年獲得IBM獎(jiǎng)學(xué)金,2009年獲得中科院院長(zhǎng)獎(jiǎng)。

他現(xiàn)為百度智慧醫(yī)療主任研發(fā)架構(gòu)師,WHO數(shù)字健康專委會(huì)委員,中國(guó)科學(xué)院慈溪醫(yī)工所客聘教授,新加坡眼科研究所客聘研究員,IEEE高級(jí)會(huì)員,全國(guó)智能眼科學(xué)組常委。

他目前擔(dān)任醫(yī)療影像頂會(huì)MICCAI和IPMI組委會(huì)委員,Medical Imaging和BioMedical Engineering Online期刊編委,ACPR、ACCAS等國(guó)際學(xué)術(shù)會(huì)議主席及程序委員會(huì)委員,眼科醫(yī)學(xué)影像國(guó)際會(huì)議OMIA和國(guó)際比賽平臺(tái)iChallenge創(chuàng)始主席。

加拿大西安大略大學(xué)副教授 李碩

李碩從中國(guó)科技大學(xué)畢業(yè)后,在2006年獲得加拿大肯高迪亞大學(xué)博士學(xué)位,并于2007年獲肯高迪亞大學(xué)博士生獎(jiǎng),隨后加入GE醫(yī)療。

李碩現(xiàn)任加拿大西安大略大學(xué)醫(yī)學(xué)影像和醫(yī)學(xué)生物物理學(xué)系任副教授、MICCAI Society董事會(huì)成員、勞森健康研究院研究員。

他已在TPAMI、MIA、TNNLS、TMI、CVPR等國(guó)際頂級(jí)雜志和會(huì)議上發(fā)表多篇學(xué)術(shù)論文,并擔(dān)任過TMI、CMIG、CVIU等國(guó)際頂級(jí)期刊的特刊客座編輯,擔(dān)任過AnalytiX 2013分會(huì)主席。

南方科技大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與工程系 劉江

劉江畢業(yè)于中國(guó)科技大學(xué)計(jì)算機(jī)系少年班,碩士和博士畢業(yè)于新加坡國(guó)立大學(xué)計(jì)算機(jī)系。

2007年,他創(chuàng)建了新加坡科研局下屬的的眼科醫(yī)療圖像處理團(tuán)隊(duì)“iMED新加坡”,專注于眼科人工智能研究,歸國(guó)前任IEEE生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)會(huì)新加坡地區(qū)主席。

2016年3月, 劉江回到中國(guó),創(chuàng)立了“iMED寧波“團(tuán)隊(duì),組建了中科院寧波慈溪生物醫(yī)學(xué)工程研究所,并任創(chuàng)所首任所長(zhǎng)和高級(jí)研究員。

2019年2月,劉江加入南方科技大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與工程系,創(chuàng)立”iMED深圳“團(tuán)隊(duì),在眼腦聯(lián)動(dòng),人工智能、精準(zhǔn)醫(yī)療、和手術(shù)機(jī)器人方向進(jìn)一步展開科研工作。

劉江曾先后獲得新加坡國(guó)家眼科研究中心首席科學(xué)家,新加坡卓越工程師獎(jiǎng), 東南亞國(guó)家聯(lián)盟圖像系統(tǒng)設(shè)計(jì)獎(jiǎng),IEEE 生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)會(huì)新加坡地區(qū)主席等榮譽(yù)和獎(jiǎng)項(xiàng)。

上海大學(xué)電子信息工程系系主任 施俊

施俊是中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)電子工程與信息科學(xué)系本碩博連讀,于2005年獲生物醫(yī)學(xué)工程博土學(xué)位。

他在讀博期間曾任香港理工大學(xué)研究助理,香港理工大學(xué)短期訪問學(xué)者,美國(guó)北卡羅來納大學(xué)——教堂山分校訪問學(xué)者。

施俊主持了國(guó)家自然科學(xué)基金青年基金、合作主持國(guó)家自然科學(xué)基金重大科研儀器研制項(xiàng)目和重點(diǎn)項(xiàng)目,以及主持上海市自然科學(xué)基金項(xiàng)目、科委、教委項(xiàng)目等多項(xiàng)項(xiàng)目。

他還擔(dān)任中國(guó)醫(yī)學(xué)裝備協(xié)會(huì)超聲裝備分會(huì)常務(wù)委員、中國(guó)信息協(xié)會(huì)醫(yī)療衛(wèi)生和健康產(chǎn)業(yè)分會(huì)醫(yī)學(xué)人工智能學(xué)組常務(wù)委員、中國(guó)影像AI產(chǎn)學(xué)研用創(chuàng)新聯(lián)盟理事。

目前,施俊就職于上海大學(xué)通信與信息工程學(xué)院,任電子信息工程系系主任。

生物計(jì)算

中國(guó)科學(xué)院院士 陳潤(rùn)生

陳潤(rùn)生院士1964年畢業(yè)于中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)生物物理系,2007年當(dāng)選為中國(guó)科學(xué)院院士。

現(xiàn)為中國(guó)科學(xué)院生物物理研究所研究員、博士生導(dǎo)師,國(guó)際人類基因組組織(HUGO)會(huì)員。

陳潤(rùn)生二十多年來一直在生物信息學(xué)領(lǐng)域進(jìn)行了系統(tǒng)的研究,曾參加過第一個(gè)完整基因組泉生熱袍菌B4基因組序列的組裝和基因標(biāo)識(shí),曾參加人類基因組1%和水稻基因組工作重建了收錄非編碼RNA及其基因的數(shù)據(jù)庫(kù)NONCODE,以及收錄非編碼RNA與其他生物大分子相互作用的數(shù)據(jù)庫(kù)NPInter,這兩個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)如今已成為國(guó)際在非編碼RNA領(lǐng)域非常有影響力的數(shù)據(jù)庫(kù)。

由于其在基因組信息學(xué)領(lǐng)域的早期工作,陳潤(rùn)生曾榮獲何梁何利基金科學(xué)與技術(shù)進(jìn)步獎(jiǎng),談家楨生命科學(xué)成就獎(jiǎng),國(guó)家科學(xué)技術(shù)進(jìn)步獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)(第一完成人)。

中國(guó)科學(xué)院院士 施蘊(yùn)渝

施蘊(yùn)渝院士1965年畢業(yè)于中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)物理系生物物理專業(yè),畢業(yè)后進(jìn)入衛(wèi)生部中醫(yī)研究院擔(dān)任實(shí)習(xí)研究員。

1997年,施蘊(yùn)渝當(dāng)選為中國(guó)科學(xué)院院士;1998年,擔(dān)任中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院首任院長(zhǎng);

2001年至2010年,她又擔(dān)任教育部高等學(xué)校生物科學(xué)與生物工程教學(xué)指導(dǎo)委員會(huì)主任。

2009年,正式當(dāng)選為第三世界科學(xué)院院士。

施蘊(yùn)渝院士和她領(lǐng)導(dǎo)的課題組,曾深入開展了與蛋白質(zhì)分子設(shè)計(jì)及藥物設(shè)計(jì)有關(guān)的基礎(chǔ)理論和方法學(xué)的研究,包括酶與底物,藥物與受體結(jié)合自由能的計(jì)算;蛋白質(zhì)穩(wěn)定性的計(jì)算機(jī)模擬;蛋白質(zhì)分子的隨機(jī)動(dòng)力學(xué)模擬;蛋白質(zhì)靜電相互作用研究,以及酶作用機(jī)理的計(jì)算機(jī)模擬。

此外,她還是國(guó)內(nèi)最早開展生物大分子二維核磁共振實(shí)驗(yàn)的幾個(gè)人之一,她領(lǐng)導(dǎo)的實(shí)驗(yàn)室建立了多維核磁共振實(shí)驗(yàn)研究蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的系統(tǒng)方法,研究了一些重要蛋白質(zhì)如轉(zhuǎn)錄因子,蝎毒蛋白(鉀通道拮抗物)的溶液結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系,揭示蛋白質(zhì)相互作用及其功能意義。

加拿大皇家科學(xué)院院士 李明

李明院士1978年就讀于中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)研究生院,后在美國(guó)康奈爾大學(xué)獲得博士學(xué)位,哈佛大學(xué)博士后,是現(xiàn)代信息、生物信息學(xué)的世界級(jí)權(quán)威。

現(xiàn)為加拿大滑鐵盧大學(xué)的講座教授(University Professor),Canada Research Chair,加拿大皇家科學(xué)院院士, ACM和IEEE的Fellow,2010年獲得加拿大頂級(jí)國(guó)家科學(xué)獎(jiǎng) Killiam Prize。

他是研究Kolmogorov復(fù)雜性的權(quán)威專家,在研究機(jī)器學(xué)習(xí)、算法平均復(fù)雜度、信息距離和生物信息學(xué)方面做出過貢獻(xiàn)。在Nature, PNAS, Scientific American, JACM, CACM, FOCS, STOC等雜志會(huì)議發(fā)表過許多非常有影響的文章。

李明院士還創(chuàng)辦薄言信息(專注于下一代人工智能技術(shù)研發(fā)),其產(chǎn)品“薄言豆豆”是世界上第一款深度學(xué)習(xí)智能機(jī)器人。

此外,作為中科大客座教授,他還為中科大培育了許錦波、余立渤、張澤峰等多位世界級(jí)的學(xué)者。

芝加哥TTI教授許錦波

許錦波教授畢業(yè)于中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)計(jì)算機(jī)系,之后就讀于中國(guó)科學(xué)院計(jì)算技術(shù)研究所和加拿大滑鐵盧大學(xué)。

他是美國(guó)芝加哥豐田計(jì)算技術(shù)研究所教授,《生物信息學(xué)》以及《計(jì)算生物學(xué)》編委;

許錦波的研究興趣包括人工智能和機(jī)器學(xué)習(xí),優(yōu)化算法和計(jì)算生物學(xué)。

他于2016年證明了深度殘差卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)可以大大提高蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的性能,引導(dǎo)了深度學(xué)習(xí)在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)領(lǐng)域的第一次變革。

許錦波還研發(fā)了許多廣受歡迎的生物信息學(xué)軟件,其中包括久負(fù)盛名的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)軟件RaptorX和蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析軟件IsoRank。

此外,他還獲得美國(guó)斯隆研究獎(jiǎng),美國(guó)自然科學(xué)基金早期職業(yè)獎(jiǎng),《PLoS Computational Biology》創(chuàng)新突破獎(jiǎng),國(guó)際計(jì)算生物學(xué)頂級(jí)會(huì)議RECOMB的最佳論文獎(jiǎng)和時(shí)間考驗(yàn) (Test-of-Time) 獎(jiǎng)。

深圳灣實(shí)驗(yàn)室資深研究員 周耀旗

周耀旗畢業(yè)于中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)化學(xué)物理系,在2000年任紐約州立大學(xué)布法羅分校助理教授,2004年升為終身副教授;并在2006年成為印第安納大學(xué)信息學(xué)院和醫(yī)學(xué)院教授,2013年起是澳大利亞格里菲斯大學(xué)糖組學(xué)研究所教授。

周耀旗在生物信息學(xué)及其在分子生物學(xué)的應(yīng)用交叉領(lǐng)域多次作出獨(dú)特、原創(chuàng)性貢獻(xiàn)。其中包括提出“蛋白質(zhì)天然態(tài)就是表面融化固體”這個(gè)新概念、一個(gè)基于統(tǒng)計(jì)力學(xué)方法的全原子勢(shì)函數(shù)DFIRE、基于模版的蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)方法SPARKS,以及第一個(gè)把深度學(xué)習(xí)方法應(yīng)用于蛋白質(zhì)主鏈結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)(SPIDER/SPOT-1D)以及RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)(SPOT-RNA)。

他還提出利用破壞靶蛋白結(jié)構(gòu)來設(shè)計(jì)不會(huì)有抗藥性的小肽新藥、通過高通量測(cè)序來推斷RNA結(jié)構(gòu)的新方法等等,曾經(jīng)多次在國(guó)際蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)和功能預(yù)測(cè)比賽中名列前茅。

周耀旗現(xiàn)任深圳灣實(shí)驗(yàn)室系統(tǒng)與物理生物學(xué)所資深研究員。

德克薩斯大學(xué)達(dá)拉斯分校教授 Michael Q. Zhang

Michael Q. Zhang畢業(yè)于中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)學(xué)習(xí)機(jī)械工程專業(yè)。

1981年,在李政道先生發(fā)起和組織的CUSPEA項(xiàng)目資助下,他到美國(guó)羅格斯大學(xué)師從Joel Lebowitz教授研究非平衡統(tǒng)計(jì)物理學(xué)。

在此期間,他訪問了哈佛大學(xué)的Author Jaffe教授,并學(xué)習(xí)了SUSY(Supersymmetry)場(chǎng)論。

1987年,他在Jerry Percus教授的指導(dǎo)下進(jìn)行非均勻流體模型的密度或熵泛函的博士后研究,隨后在紐約大學(xué)Courant研究所與Peter Lax教授進(jìn)行可積系統(tǒng)研究。

Michael Q. Zhang教授是國(guó)際權(quán)威計(jì)算生物學(xué)和基因組學(xué)研究專家,他是最早致力于利用計(jì)算生物學(xué)方法解碼基因組信息的科學(xué)家之一。

他早期成就包括開發(fā)了第一個(gè)人類基因和啟動(dòng)子的預(yù)測(cè)算法,利用DNA芯片分析酵母動(dòng)態(tài)基因表達(dá)和細(xì)胞周期調(diào)控的工作開創(chuàng)了計(jì)算功能基因組學(xué)的新時(shí)代。

2013年,Michael Q. Zhang教授和湯超教授共同作為總編,創(chuàng)辦了Quantitative Biology期刊。

Michael Q. Zhang教授目前任職于德克薩斯大學(xué)達(dá)拉斯分校。

在此之前,他曾在冷泉港實(shí)驗(yàn)室(CSHL)的沃森生物科學(xué)學(xué)院擔(dān)任教授多年,還擔(dān)任清華大學(xué)兼職教授、杰出客座教授及北京大學(xué)定量生物學(xué)中心的學(xué)術(shù)委員。

波士頓大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程系教授 翁志平

翁志平教授于1992年畢業(yè)于中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué),獲得電氣工程學(xué)士學(xué)位。

1993年,她進(jìn)入波士頓大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程系,并獲得博士學(xué)位。

1997年,她的論文研究重點(diǎn)是計(jì)算生物學(xué),尤其是計(jì)算蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用的結(jié)合自由能。1997年1月,他被任命為波士頓大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程講師。在此期間,她主要負(fù)責(zé)生物信息學(xué)項(xiàng)目和生物信息學(xué)核心課程的開發(fā)。

1999年1月,波士頓大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程系決定在生物信息學(xué)領(lǐng)域發(fā)展。經(jīng)過全國(guó)范圍內(nèi)的選拔,任命翁志平為終身副教授。直到2007年12月,她的研究一直專注于開發(fā)計(jì)算方法,以獲得轉(zhuǎn)錄調(diào)控和蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的預(yù)測(cè)理解。

北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院生物信息中心 魏麗萍

魏麗萍出身于中科大無線電電子學(xué)系,是由美國(guó)斯坦福大學(xué)培養(yǎng)的生物信息學(xué)領(lǐng)域國(guó)際上第一批正規(guī)博士生,自1994年起一直從事生物信息學(xué)研究工作。

2000—2001年,在美國(guó)Exelixis公司信息部擔(dān)任研究員。2001-2003年擔(dān)任美國(guó)Nexus Genomics公司共同創(chuàng)始人及首席科學(xué)家。2002-2004年,擔(dān)任美國(guó)斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)系客座助理教授。

魏麗萍教授現(xiàn)任北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院生物信息中心主任,蛋白質(zhì)工程與植物基因工程國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室副主任。

清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院副教授 張強(qiáng)鋒

張強(qiáng)鋒畢業(yè)于中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)“少年班”,在這所校園里度過了整整10年,直到獲得中科大計(jì)算機(jī)博士學(xué)位。2006年,繼續(xù)赴哥倫比亞大學(xué)攻讀博士。

張強(qiáng)鋒曾對(duì)留學(xué)期間的經(jīng)歷表示:“我其實(shí)花了很多的時(shí)間,在哥大一開始非常的辛苦,我是純粹的計(jì)算機(jī)科學(xué)背景,之前完全沒有學(xué)過生物,然后突然切換到一個(gè)生物領(lǐng)域研究生的角色,其實(shí)完全不懂。別人五分鐘可以回答的問題,我可能要查上三天的資料,從零開始學(xué)習(xí)。一到考試季,只能使用達(dá)芬奇睡眠法,常常幾個(gè)星期幾乎不眠不休。”

在之后的研究中,張強(qiáng)鋒從熱門的計(jì)算機(jī)領(lǐng)域轉(zhuǎn)向計(jì)算和高通量實(shí)驗(yàn)相結(jié)合的結(jié)構(gòu)生物信息學(xué),以及RNA特別是RNA結(jié)構(gòu)和RNA組學(xué)等研究。

從2015年開始,張強(qiáng)鋒回國(guó)任清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院助理教授,2018年至今任清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院副教授,同時(shí)也是清華大學(xué)結(jié)構(gòu)生物學(xué)高精尖創(chuàng)新中心PI,曾獲拜耳研究員獎(jiǎng)、楊森研究員獎(jiǎng)。

中科院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院 戴磊

戴磊本科進(jìn)入中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)學(xué)習(xí),但最開始的學(xué)習(xí)方向并非生物,而是物理。

隨后,他來到麻省理工學(xué)院攻讀博士。基于微生物群系統(tǒng)實(shí)驗(yàn),戴磊成功觀測(cè)到生物系統(tǒng)臨界點(diǎn),并初步揭示了該系統(tǒng)在臨界點(diǎn)附近的行為規(guī)律。

這項(xiàng)研究同時(shí)具有更廣泛的普世意義,不僅對(duì)于自然生態(tài),甚至健康、經(jīng)濟(jì)等狀態(tài)變化的預(yù)測(cè)都具有積極意義。

這項(xiàng)研究獲得了包括中國(guó)工程院院士、美國(guó)科學(xué)院院士等國(guó)內(nèi)外同行專家的高度認(rèn)可。

戴磊于2018年,加入中科院深圳先進(jìn)院合成生物學(xué)研究所,現(xiàn)任深圳市合成生物學(xué)創(chuàng)新研究院合成微生物組學(xué)研究中心主任。

輝瑞科學(xué)家 崔景榮

崔景榮博士畢業(yè)于中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)應(yīng)用化學(xué)系,在中科大獲得學(xué)士與碩士學(xué)位,后在俄亥俄州立大學(xué)獲得博士學(xué)位,并在勞倫斯伯克利國(guó)家實(shí)驗(yàn)室從事博士后研究。

她現(xiàn)為輝瑞公司科學(xué)家,所領(lǐng)銜的團(tuán)隊(duì)因發(fā)明治療肺癌新藥“克里唑替尼”(Xalkori)于2011年榮獲美國(guó)第38屆年度國(guó)家發(fā)明獎(jiǎng)。

該藥2011年在美國(guó)上市,之后在北京協(xié)和醫(yī)院、解放軍307醫(yī)院等地進(jìn)行中國(guó)臨床三期實(shí)驗(yàn)。2013年,中國(guó)食品藥品監(jiān)督管理局(SFDA)批準(zhǔn)該藥在中國(guó)上市。

香港科技大學(xué)化學(xué)系教授 黃旭輝

黃旭輝教授畢業(yè)于中科大化學(xué)物理系, 曾獲第十六屆中國(guó)青年科技獎(jiǎng)。

黃旭輝教授的研究焦點(diǎn)是動(dòng)態(tài)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)動(dòng)力和化學(xué)理論的應(yīng)用和演變,以開發(fā)算法和電腦模擬技術(shù),并像電影一樣揭示身體內(nèi)的細(xì)胞如何操作這些復(fù)雜的機(jī)器。

他的跨學(xué)科研究對(duì)這種分子機(jī)器的運(yùn)動(dòng)情況進(jìn)行建模。黃教授的研究小組就細(xì)胞在RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄過程中如何自我校正錯(cuò)誤方面,取得重大突破,這與阿爾茨海默癥等疾病和人體老化出現(xiàn)的問題有關(guān)。

2006年,黃旭輝獲得斯坦福大學(xué)Simbios杰出博士后學(xué)者。

2010年,他加入香港科技大學(xué),任化學(xué)系助理教授,后陸續(xù)擔(dān)任生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)系助理教授、化學(xué)系副教授等職位,現(xiàn)為香港科技大學(xué)化學(xué)系教授。

加利福尼亞大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)系教授 姜濤

姜濤畢業(yè)于中國(guó)科技大學(xué)無線電系,1982年榮獲郭沫若獎(jiǎng)學(xué)金。

1988年,他獲美國(guó)明尼蘇達(dá)大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)博士學(xué)位,1989-2001年在加拿大McMaster大學(xué)計(jì)算與軟件系任助理教授、副教授、教授。

1999年至今,姜濤任美國(guó)加利福尼亞大學(xué)Riverside分校計(jì)算機(jī)科學(xué)系教授,研究領(lǐng)域?yàn)橛?jì)算分子生物學(xué)、生物數(shù)據(jù)庫(kù)和算法設(shè)計(jì)與分析等。

他發(fā)展了一系列用于序列比對(duì)、系統(tǒng)發(fā)育分析、比較基因組學(xué)和DNA芯片等生物信息學(xué)算法。

由于在科研工作中做出了突出貢獻(xiàn),姜濤在2003年國(guó)際計(jì)算分子生物學(xué)研究會(huì)議(RECOMB‘2003)上獲得最佳海報(bào)獎(jiǎng),在2004年獲得第15屆國(guó)際基因信息學(xué)大會(huì)最佳論文獎(jiǎng),并于2006年當(dāng)選為美國(guó)科學(xué)促進(jìn)會(huì)會(huì)士。

結(jié)語

紅專并進(jìn)一甲子,科教報(bào)國(guó)六十年,從兩彈一星的空白,到航空航天世界領(lǐng)先;從首屈一指的量子通訊,到人工智能與大數(shù)據(jù),中科大一直默默為國(guó)家最尖端的科技發(fā)展做出貢獻(xiàn)。

從創(chuàng)校至今,中科大的本科終招生數(shù)量都在2000人以下水平,也許在未來,依然無法看到中科大像其他大學(xué)一樣在多個(gè)領(lǐng)域,多個(gè)企業(yè)開枝散葉。

但當(dāng)我們沉下心來,尋找其中的枝枝蔓蔓,就一定能發(fā)現(xiàn)中科大學(xué)子在每個(gè)關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)所踩出的堅(jiān)實(shí)腳印。

原文標(biāo)題:中科大:醫(yī)療AI界的「黃埔軍校」

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原文標(biāo)題:中科大:醫(yī)療AI界的「黃埔軍校」

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